前作で語られなかった部分に焦点を当て、各キャラが迎えた明日と、その中で起きる出来事を描いた物語を中心として、前日譚とも言うべき、魔女リーゼロッテと壮絶な戦いを繰り広げた禁書目録聖省の使徒たちの物語や、中世の南フランスを舞台にしたリゼットとヴェラードの物語など、様々なストーリーが用 ‥‥

隻眼の少年「皐月駆」が、たった1人の肉親である姉を喪ったのは5年前のことだった。幼馴染「水奈瀬ゆか」の健気な対応のお陰か、今では何とか心の平静を取り戻してはいたが、駆の心にはどこか虚無感が漂い、未来に希望を抱けないまま怠惰な日々を送っていた。新興都市「綾女ヶ丘市」にある「虹陵館学 ‥‥